Im Menü des Messengers 'Einstellungen - Account' gibt es einen Punkt 'Nummer ändern'. Hierunter müssen die Nutzer die bislang verwendete und anschließend die neue Handynummer eingeben. Danach verschickt WhatsApp eine SMS an die neue Rufnummer. Auf Android- und Blackberry-Smartphones wird diese von WhatsApp automatisch ausgewertet. Bei iOS und Windows Phone muss der in der SMS angegebene Link angeklickt werden, um die Umregistrierung abzuschließen. Bisherige Chats und Gruppen bleiben bei dieser Vorgehensweise erhalten und die Nummer wird automatisch aktualisiert.
Es besteht auch die Möglichkeit, eine Festnetznummer anstelle der Handynummer bei WhatsApp anzugeben. Dies kann sinnvoll sein, wenn Nutzer eine Festnetznummer auf dem Handy für die Erreichbarkeit einsetzen. Der WhatsApp-Code, zur Freischaltung der Nummer, kommt in der Regel auf der Festnetznummer nicht an. Als Alternative kann der Prüfcode per automatisiertem Anruf empfangen werden. Zunächst müssen fünf Minuten abgewartet werden, in denen WhatsApp die Verifizierung per SMS versucht. Anschließend besteht die Möglichkeit, den Anruf auszulösen. Dieser erfolgt innerhalb weniger Sekunden und der Code wird in deutscher Sprache angesagt. Nun ist die Festnetznummer per WhatsApp erreichbar.